Das Kloster wird 557 von Chlothar über dem Grab des Medardus vor den Toren der Stadt gegründet, aber erst nach seinem Tode 561 von seinem Sohn Sigebert fertiggestellt, die beide in der Kirche begraben wurden. Schon zur Gründung wurden die Reliquien des Heiligen Medardus hier verehrt. 751 fand hier die Krönung Pippins zum Frankenkönig statt, die Salbung durch den Papst erfolgte später in Saint-Denis. Durch die Karolinger, besonders Karl und seinen Sohn Ludwig, wurde Saint-Médard zu einer der mächtigsten Abteien des Reiches mit einer Kirchengruppe ausgebaut. Dabei entstand in Anlehnung an Saint-Denis ein breiter Querriegel als Westbau, der möglicherweise bereits um 790 begonnen wurde, als Karl in Neustrien aktiv war. Bereits vor 826 war er fertiggestellt. 826 fügte man für die Reliquientranslation des Sebastian eine dreischiffige Krypta an.

Von den Wikingern wurde das Kloster im 11. Jahrhundert zerstört. Die danach wieder aufgebaute Kirche erlitt 1567 erneute Verwüstungen. Nach dem Wiederaufbau wurde schließlich 1793 das Kloster bis auf die Krypta endgültig demoliert.

Le monastère est fondé en 557 par Chlothar sur la tombe de Médard aux portes de la ville, mais n'est achevé qu'après sa mort en 561 par son fils Sigebert, tous deux enterrés dans l'église. Dès la fondation, les reliques de saint Médard y étaient vénérées. En 751, le couronnement de Pépin comme roi des Francs eut lieu ici, l'onction par le pape eut lieu plus tard à Saint-Denis. Les Carolingiens, en particulier Charles et son fils Louis, firent de Saint-Médard l'une des plus puissantes abbayes de l'empire, avec un groupe d'églises. En s'inspirant de Saint-Denis, un large transept fut érigé comme bâtiment occidental, dont la construction fut peut-être déjà commencée vers 790, alors que Charles était actif en Neustrie. Il était déjà achevé avant 826. En 826, on y ajouta une crypte à trois nefs pour la translation des reliques de Sébastien.

Le monastère a été détruit par les Vikings au 11e siècle. L'église, reconstruite par la suite, a de nouveau été dévastée en 1567. Après la reconstruction, le monastère fut finalement démoli en 1793, à l'exception de la crypte.

- Skalecki, Georg 2024. S. 5-44, Kat. A30. [...]