Wie die meisten Juraklöster ist auch Saint-Hymetière im 6. Jahrhundert von Saint-Claude (Condatiscone) (obj-470) gegründet worden. Merowingische Gräber belegen dies. Der Gründer Hymeritus starb hier und sein Grab wurde bald verehrt und ist bis heute in der Apsis des Südquerschiffs erhalten. Über die frühen Bauten gibt es keine Erkenntnisse. Der bestehende Bau mit Querhaus, Apsiden und Vierungsturm stammt aus der zweiten Hälfte des 11. Jahrhunderts. In dieser Zeit unterstand das Kloster dem Dom von Mâcon. Nach Zerstörungen sind im 17. Jahrhundert das Langhaus und das Nordschiff verändert worden.

Comme la plupart des monastères jurassiens, Saint-Hymetière a été fondé au 6e siècle par Saint-Claude (Condatiscone) (obj-470). Des tombes mérovingiennes l'attestent. Le fondateur Hymeritus y est mort et sa tombe a rapidement été vénérée et a été conservée jusqu'à aujourd'hui dans l'abside du transept sud. On ne dispose d'aucune information sur les premières constructions. La construction existante avec transept, absides et tour de la croisée date de la deuxième moitié du 11e siècle. A cette époque, le monastère dépendait de la cathédrale de Mâcon. Après des destructions, la nef et la nef nord ont été modifiées au 17e siècle.