Le monastère de Guénolé fut fondé dès 485. Des fouilles laissent supposer que la première église était un édifice à nef unique. Après 818, le site connut un essor considérable, marqué par de nouvelles constructions et l'exhumation des reliques de Guénolé, qui furent exposées aux pèlerins dans une tombe située dans le chour. Il s'agissait d'un édifice à trois nefs avec un chour rectangulaire. On ignore si un corps ouest existait déjà à cette époque. Au plus tard au milieu du IXe siècle, un corps ouest en trois parties, avec une partie centrale en saillie, vint toutefois s'y ajouter. On y a découvert des tombes appartenant vraisemblablement à des personnalités laïques de haut rang, une configuration typique des corps ouest carolingiens. En 913, le complexe fut détruit par les Vikings. Par la suite, l'édifice existant fut probablement simplement restauré. Une nouvelle construction romane de grande envergure a vu le jour à partir du début du XIe siècle. Elle comportait un choeur à déambulatoire. La nef à trois vaisseaux s'étendait largement à l'ouest au-delà de l'ancien édifice et n'a pas été dotée d'une nouvelle partie ouest. Malgré des modifications ultérieures, cet état est aujourd'hui largement conservé, bien qu'en ruines. Au milieu du XVIIe siècle, le monastère fut à nouveau partiellement détruit, puis reconstruit. Après la Révolution, les bâtiments furent partiellement démolis à partir de 1810 ; seules des ruines subsistent aujourd'hui.